شناسایی مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس با استفاده از روش ترادف یابی چند جایگاهی

مقدمه: مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس به صورت گسترده در محیط وجود دارند و عامل ایجاد کننده بیماری در حیوانات، پرندگان و بیماران نقص سیستم ایمنی و افراد سالم می باشد. هدف از این مطالعه به کارگیری روش ترادف یابی چند جایگاهی (MLSA) در شناسایی مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس بود. روش کار: در این مطالعه، ابتدا توالی ژن های 16S rRNA، rpoB و hsp65 برای 8 زیر گونه از کمپلکس مایکوباکتریوم آویوم از بانک ژنی جمع آوری شد. سپس این توالی ها به وسیله نرم افزار clustalW2 هم ردیف شدند و براساس این ژن ها درخت های فیلوژنتیکی رسم شد. در نهایت، توسط نرم افزار CLC Main benchwork توالی مربوط به هر زیر گونه با هم ترکیب شد و درخت فیلوژنتیک با روش neighbor-joining رسم شد.   یافته ها: نتایج مبنی بر روش MLSA بهتر از مطالعه جداگانه ژن های 16S rRNA، rpoB و hsp65 بود. نتیجه گیری: روش MLSA ابزاری مفید برای شناسایی و افتراق زیرگونه های مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس است.